哪里可以找到果蝇的lncRNA数据库

关系的综合注释和发现。ChIPBase的当前版本包括了通过在来自六种生物体的不同组织和细胞系中的543个ChIP-Seq实验产生的高通量测序数据。

通过分析数以百万计的TFBSs，我们鉴定了数以万计的TF-lncRNA和TF-miRNA调控关系。此外，开发了两个基于网络的服务器以从ChIP-Seq数据中注释和发现lncRNAs和miRNAs的转录调控关系。另外，我们开发了两个基因组浏览器deepView和ge

有免费的在线数据库可以预测，比如 StarBase，这是一个高通量实验数据CLIP-Seq（或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP）和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库，整合多个预测软件，预测miRNA靶基因，包含了miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA，miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。构建了最全面的包含了14种癌症类型（>6000个样本）Pan-Cancer（泛癌）表达图谱和互作网络。

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