怎么在EBI数据库上批量下载搜索到的某个菌的不同亚种的某个基因的序列

我记得ensembl有个comparative genomics，可以找到不同物种同一个基因或是同系物或旁系物的序列，然后直接进行比对，找到保守区域，感觉跟题主的需求相似，就是需要看一下ensembl是否包含你感兴趣的那些细菌亚种的基因组数据

​Ensembl

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NCBI上可以查分子量，还有其它的方也可以查。我推荐几个吧：

Genecards: :>

我硕士读的是细胞生物学，今年4月开始在boss要求下自学perl，打听了下，<learning perl>这本书不错，就买来开始看，等5月份去北京参加公司的培训班时，<learning perl>读了一遍，<intermediate perl>看了一部分。培训回来，我们的项目就开始做了，9月拿到所有原始数据和分析结果。然后，我对照着公司的分析报告，试着自己走一边分析流程，中间遇到问题，自己解决不了的，就发邮件求助。有几点需要注意：1 我能理解你想早些玩儿数据的愿望，但是在这之前，最好要有一个outline需要知道数据从哪儿来的，怎么产生的？其实就是测序仪的工作原理。然后是数据质量检验，为什么需要数据过滤？接着是reads拼接和组装。总之，要对整个流程有一个认识，而后在学习的过程中，再不断回头对比这个流程，这样才不会有迷失的感觉。2 有了基础知识的铺垫，就可以尝试着自己做些练习了，paper上面都会给出他们的数据、原码地址，可以找来自己试试，先看看自己能不能做出一样的效果。当然，这时要是你手里正好有项目，那就更好了。3 学生物信息，paper肯定是要跟踪的。覆盖生物信息有趣的论文， 算法，以及生物科学问题。这个网站还汇集了很多生物信息领域科学家的博客。再如BGI的主程罗瑞邦， SAMtools、BWA的作者Heng Li都有在这里出现。[RNA-Seq Blog](RNA-Seq Blog) 推荐新的论文、工作、培训课程、大型会议等。如果你是生物背景的，那么计算机方面的知识需要补一下：需要能在linux环境下舒服的工作。比如从源码编译安装软件PATH配置，再比如舒服地使用google找到问题的答案。学会使用python/perl。比如有的时候运行一个软件老是报错，可能就是因为在一个包含几十万行的文本文件里，有随机的那么几千行的末个位置，多一个冒号, 这时候你知道需要怎么做了？ 学会R。要从一大堆基因里面找出表达水平变化的基因来，需要统计分析和显著检验；而要把我们的数据更直观地展示出来，最好的方式就是图形了吧。这两个需要，R都能满足。当然matlab也是可以的，区别在于R是开源工具。具备了上述技能，那么常用的软件就能用起来了。随着学习的深入，可能你的问题别人也没遇到过，这时候就需要自己动手，要么修改现成的工具，要么自己做一个出来。这时候，除了python/perl，或许还可以学C/C++/java，或许需要研究下比如BWT、De Bruijn Graph背后的原理。

IARS2-003指isoleucyl-tRNA synthetase 2基因003转录本。

ENST00000490891是IARS2-003的transcript ID，OTTHUMT00000090763是另一个数据库对同一转录本的编号（Havana transcript）。

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