分析miRNA的数据库都有哪些

分析miRNA的数据库都有哪些,第1张

如果是要初步的筛选,最好用至少3个数据库进行预测,然后取共有的target

gene进行下一步的验证,常用的数据库有targetscan,rna22,mirbase,pita,microcosom等等

miRNA深度测序?你意思高通量测序吧。技术特点没什么可说的,如果你了解高通量测序的流程的话。

mirna一般是通过割胶回收短序列RNA,建好mirna的文库后,进行高通量测序。只不过mirna测序分析有一些特点,比如说mirna的预测,以及靶基因的预测(主要基于数据库比对和mirna的前体的发卡结构)。

截止目前外泌体数据库Exocarta显示,已有9769种蛋白质,3408种RNA,2838种miRNA及1116种脂质在外泌体中被发现(http://www.exocarta.org/)。相比较蛋白质,RNA,miRNA的研究,外泌体脂质的研究相对较少。


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