nii文件是NIFTI格式的文件,出现的原因是原来一种图像格式是ANALYZE 7.5 format,但是这个图像格式缺少一些信息。
比如没有方向信息,病人的左右方位等,如果需要包括额外的信息,就需要一个额外的文件,比如ANALYZE7.5就需要一对文件来保存图像的完整信息。
因此,解决这个问题Data Format Working Group (DFWG) 将图像格式完整的定义为NIFTI(Neuroimaging Informatics Technology Initiative)格式。
matlab打开nii格式的图像方法有两种:
①Tools
for
NIfTI
(ANALYZE)
MR
image
这个Matlab程序包用于处理核磁共振图像,可以读取显示、保存、制作该图像。
具体如下:
help
load_nii_img
>>
[hdr,filetype,fileprefix,machine]
=
load_nii_hdr('output.hdr')
>>
[img,hdr]
=
load_nii_img(hdr,filetype,fileprefix,machine)
cd
('F:\Tongren\liuzhaohui\')
nii
=
load_nii('talairach.nii')
idx
=
find
(nii.img==43)
nii.img(:)
=
0
nii.img(idx)
=
1
%tnii
=
make_nii(nii.img)
save_nii
(nii,'43.nii')
②SPM方法:
help
spm_read_vols
V
=
spm_vol_nifti('output.hdr')
[Y,XYZ]
=
spm_read_vols(V)
有一个库叫做simpleitk,他提供函数可以直接读入nii文件然后可以存成dcm的格式。例如:
img=sitk.ReadImge(”aa.nii”)
sitk.WriteImge(img,filename)
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