http://blog.sina.com.cn/greensim)。 function
[y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)%%
偏最小二乘回归的通用程序%
注释以“基于近红外光谱分析的汽油组分建模”为例,但本程序的适用范围绝不仅限于此%
GreenSim团队原创作品(
http://blog.sina.com.cn/greensim)%%
输入参数列表%
X
校正集光谱矩阵,n×k的矩阵,n个样本,k个波长%
Y
校正集浓度矩阵,n×m的矩阵,n个样本,m个组分%
x
验证集光谱矩阵%
y
验证集浓度矩阵%
p
X的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定%
q
Y的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定%%
输出参数列表%
y5
x对应的预测值(y为真实值)%
e1
预测绝对误差,定义为e1=y5-y%
e2
预测相对误差,定义为e2=|(y5-y)/y| %%
第一步:对X,x,Y,y进行归一化处理[n,k]=size(X)m=size(Y,2)Xx=[Xx]Yy=[Yy]xmin=zeros(1,k)xmax=zeros(1,k)for
j=1:k
xmin(j)=min(Xx(:,j))
xmax(j)=max(Xx(:,j))
Xx(:,j)=(Xx(:,j)-xmin(j))/(xmax(j)-xmin(j))endymin=zeros(1,m)ymax=zeros(1,m)for
j=1:m
ymin(j)=min(Yy(:,j))
ymax(j)=max(Yy(:,j))
Yy(:,j)=(Yy(:,j)-ymin(j))/(ymax(j)-ymin(j))endX1=Xx(1:n,:)x1=Xx((n+1):end,:)Y1=Yy(1:n,:)y1=Yy((n+1):end,:)%%
第二步:分别提取X1和Y1的p和q个主成分,并将X1,x1,Y1,y1映射到主成分空间[CX,SX,LX]=princomp(X1)[CY,SY,LY]=princomp(Y1)CX=CX(:,1:p)CY=CY(:,1:q)X2=X1*CXY2=Y1*CYx2=x1*CXy2=y1*CY%%
第三步:对X2和Y2进行线性回归B=regress(Y2,X2,0.05)%第三个输入参数是显著水平,可以调整 %%
第四步:将x2带入模型得到预测值y3y3=x2*B%%
第五步:将y3进行“反主成分变换”得到y4y4=y3*pinv(CY)%%
第六步:将y4反归一化得到y5for
j=1:m
y5(:,j)=(ymax(j)-ymin(j))*y4(:,j)+ymin(j)end %%
第七步:计算误差e1=y5-ye2=abs((y5-y)./y)function
[MD,ERROR,PRESS,SECV,SEC]=ExtraSim1(X,Y)%%
基于PLS方法的进一步仿真分析%%
功能一:计算MD值,以便于发现奇异样本%%
功能二:计算各种p取值情况下的ERROR,PRESS,SECV,SEC值,以确定最佳输入变量个数%
GreenSim团队原创作品(
http://blog.sina.com.cn/greensim)%%[n,k]=size(X)m=size(Y,2)pmax=n-1q=mERROR=zeros(1,pmax)PRESS=zeros(1,pmax)SECV=zeros(1,pmax)SEC=zeros(1,pmax)XX=XYY=YN=size(XX,1)for
p=1:pmax
disp(p)
Err1=zeros(1,N)%绝对误差
Err2=zeros(1,N)%相对误差
for
i=1:N
disp(i)
if
i==1
x=XX(1,:)
y=YY(1,:)
X=XX(2:N,:)
Y=YY(2:N,:)
elseif
i==N
x=XX(N,:)
y=YY(N,:)
X=XX(1:(N-1),:)
Y=YY(1:(N-1),:)
else
x=XX(i,:)
y=YY(i,:)
X=[XX(1:(i-1),:)XX((i+1):N,:)]
Y=[YY(1:(i-1),:)YY((i+1):N,:)]
end
[y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)
Err1(i)=e1
Err2(i)=e2
end
ERROR(p)=sum(Err2)/N
PRESS(p)=sum(Err1.^2)
SECV(p)=sqrt(PRESS(p)/n)
SEC(p)=sqrt(PRESS(p)/(n-p))end%%[CX,SX,LX]=princomp(X)S=SX(:,1:p)MD=zeros(1,n)for
j=1:n
s=S(j,:)
MD(j)=(s')*(inv(S'*S))*(s)end
fz=@(z,x) z(1)*x.^2+z(2)*x+z(3),...'z','x'
[z,resnorm,residual,exitflag,output] = lsqcurvefit(fz,z0,x,y,[],[],options)
z0为系数矩阵初值
一般评价最小二乘非线性拟合不是用相关性系数,而是用residual,残差或残差平方和
再有一种是用nonfit,很简单的一种非线性回归,不用写函数格式
我没有看清楚,不好意思,所谓偏最小二乘法,就是指在做基于最小二乘法的线性回归分析之前,对数据集进行主成分分析降维,将最后得到的主成分作为输入的x,你可以看一下princomp这个函数是进行主成分分析的
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