参考 >
直接在NCBI主页输入你要找的基因的名字,比如S1PR1,然后搜索,找到下面的内容: Genes 90Gene: collected information about gene loci 1HomoloGene: homologous gene sets for selected organisms 12UniGene: clusters of expressed transcrip。
根据genid大批量比对拟南芥为:
1、使用BLAST(基于序列的相似性搜索)来进行Genid大批量比对拟南芥。
2、BLAST可以搜索一个或多个序列,并与其他已知序列进行比较,以确定序列之间的相似性。
3、BLAST可以根据Genid搜索拟南芥的基因组数据库,以确定Genid之间的相似性。此外,还可以使用NCBI的BLAST服务,在NCBI上搜索和比较Genid数据。
方法一
请到ncbi上blast搜索
根据已知序列种类、欲获知序列种类(DNA序列或蛋白序列)以及搜索范围选择合适的程序,比如常用的nucleotide blast
输入你的序列
FASTA格式如下
〉基因名等等,随便备注
DNA序列
根据具体情况选择各选项
点击Blast即可得到很多的同源序列
方法二
直接输入基因名,在ncbi上的nucleotide 或gene 数据库里搜索
方法三
你要获取实物那么根据该基因的保守区设计引物 PCR扩增
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